睡眠外来など医療機関での不眠症の治療は、まず患者さんの不眠の症状を把握して、睡眠衛生指導を行います。生活習慣や睡眠環境の改善を図りつつ、不眠症が十分に改善しない場合は、薬物治療を開始します。不眠症状や日中の不調（日中の倦怠感や眠気）が改善すれば徐々に薬の量を減らし、最終的には中止します。その後も安定した状態が保たれていれば、治療完了というのが大まかな流れです³⁾。

医師の指導のもとで、睡眠衛生に関する正しい知識を身につけつつ、生活習慣や睡眠環境における良質な眠りを妨げる問題点を改善していきます。

睡眠薬は種類が複数あります。効果が期待できる不眠症状や作用機序、作用時間はそれぞれ違います。医師と相談し、不眠症状や程度、原因、服用中のほかの薬剤、過去の服用歴などを考慮のうえ、選択することになります。認知行動療法（不眠症に影響をおよぼす生活習慣や過覚醒などの身体反応をカウンセリングなどで修正し、不眠症状の改善をめざす療法）を並行して行うこともあります。
薬物療法や認知行動療法の効果が思わしくない場合は、そもそもの診断や治療が適切かどうか、再評価を行います。脳波上は睡眠状態にあっても本人は眠っていないと認識している睡眠誤認状態に陥っていないか、不眠の症状が概日リズム睡眠・覚醒障害や睡眠時無呼吸症候群など不眠症とは別の睡眠障害によるものではないか⁵⁾、あらためて確認します。

治療がうまくいき不眠症状などの改善傾向が続けば、現在の治療をいつまで続けるか、治療のゴールを設定します。不眠症状の再発や再燃を避けるため、睡眠薬はいきなり中止せず、段階的に量や服用回数を減らしていきます。睡眠薬を中止したあとも、夜間の不眠症状や日中の不調がない安定した状態が一定期間保たれていれば治療終了となります。